Zusätzlich zum Bundesministeriums für wirtschaftliche Zusammenarbeit und Entwicklung (BMZ) als Auftraggeber erhält das ASA-Programm Zuwendungen mehrerer Bundesländer. Diese Bund-Länder Kooperation ermöglicht wissenschaftlichen Einrichtungen aus den kooperierenden Bundesländern ASA-Projekte einzureichen.
Im Moment läuft eine Kooperation mit den folgende Bundesländern: Baden-Württemberg, Bayern, Berlin, Bremen, Hamburg, Nordrhein-Westfalen und Sachsen.